summaryrefslogtreecommitdiff
ModeNameSize
-rw-r--r--Catacomb_Object.cc16652logplain
-rw-r--r--Catacomb_Object.hh6395logplain
-rw-r--r--Color_Table.cc5773logplain
-rw-r--r--Color_Table.hh3165logplain
-rw-r--r--Command.cc4233logplain
-rw-r--r--Command.hh2629logplain
-rw-r--r--Command_Line_Parameters.cc15111logplain
-rwxr-xr-xCommand_Line_Parameters.hh8134logplain
-rw-r--r--Connection_Statistics.cc1998logplain
-rw-r--r--Connection_Statistics.hh2118logplain
-rw-r--r--Fig_Object.cc8249logplain
-rw-r--r--Fig_Object.hh8518logplain
-rw-r--r--GPLHEADER1014logplain
-rw-r--r--IFactivity.cc6072logplain
-rw-r--r--IFactivity.hh3286logplain
-rw-r--r--INSTALL1072logplain
-rw-r--r--LICENSE35147logplain
-rw-r--r--Makefile22311logplain
-rwxr-xr-xMakefile.linux22308logplain
-rw-r--r--Makefile.mac22295logplain
-rw-r--r--Network_Generated_Statistics.cc16854logplain
-rw-r--r--Network_Generated_Statistics.hh23656logplain
-rw-r--r--Network_Statistics.cc1473logplain
-rw-r--r--Network_Statistics.hh2265logplain
-rw-r--r--README311logplain
-rw-r--r--Results.cc1081logplain
-rw-r--r--Results.hh2629logplain
-rw-r--r--Sampled_Output.cc20471logplain
-rw-r--r--Sampled_Output.hh8737logplain
-rw-r--r--Spatial_Presentation.cc4309logplain
-rw-r--r--Spatial_Presentation.hh3031logplain
-rw-r--r--Spatial_Segment_Subset.cc24759logplain
-rw-r--r--Spatial_Segment_Subset.hh4973logplain
-rw-r--r--StringList.cc3375logplain
-rw-r--r--StringList.hh2535logplain
-rw-r--r--Txt_Object.cc3647logplain
-rw-r--r--Txt_Object.hh3744logplain
-rw-r--r--VERSION14logplain
-rw-r--r--VRML_Object.cc5106logplain
-rw-r--r--VRML_Object.hh2508logplain
-rw-r--r--axon_direction_model.cc31007logplain
-rw-r--r--axon_direction_model.hh17868logplain
-rw-r--r--branching_models.cc42889logplain
-rw-r--r--branching_models.hh17634logplain
-rwxr-xr-xcircle.sh1402logplain
-rwxr-xr-xcircle_and_electrodes.sh1398logplain
-rwxr-xr-xcombine.sh488logplain
d---------common-m39logplain
-rw-r--r--connection.cc3598logplain
-rw-r--r--connection.hh6229logplain
-rw-r--r--culture-experiment-data.ascii18374logplain
d---------cygwin36logplain
-rw-r--r--dendritic_growth_model.cc25554logplain
-rw-r--r--dendritic_growth_model.hh6832logplain
-rw-r--r--diagnostic.cc8684logplain
-rw-r--r--diagnostic.hh4395logplain
d---------dil2al344logplain
-rw-r--r--environment_physics.cc15362logplain
-rw-r--r--environment_physics.hh5672logplain
-rw-r--r--evaluate-partitioning.ascii1246logplain
-rw-r--r--evaluate-partitioning.present.m2027logplain
-rw-r--r--event.cc3524logplain
-rw-r--r--event.hh3616logplain
-rwxr-xr-xextractparameters.sh2359logplain
-rw-r--r--fibre_elongation_model.cc90727logplain
-rw-r--r--fibre_elongation_model.hh42337logplain
-rw-r--r--fibre_structure.cc49370logplain
-rw-r--r--fibre_structure.hh23308logplain
-rw-r--r--file.cc2877logplain
-rw-r--r--file.hh1495logplain
-rw-r--r--fixedwidth.hh1892logplain
-rw-r--r--generic_synapse.cc1180logplain
-rw-r--r--generic_synapse.hh1752logplain
d---------geometry666logplain
-rw-r--r--global.cc31800logplain
-rw-r--r--global.hh27273logplain
-rwxr-xr-xgplheader.sh2603logplain
-rwxr-xr-xhexagon.sh1402logplain
d---------include40logplain
-rwxr-xr-xinstall.sh8281logplain
d---------mac36logplain
-rw-r--r--memory_statistics.ascii814logplain
-rw-r--r--mtprng.cc6552logplain
-rw-r--r--mtprng.hh12326logplain
-rw-r--r--network.cc94288logplain
-rw-r--r--network.hh12484logplain
-rw-r--r--neurite_diameter_model.cc5061logplain
-rw-r--r--neurite_diameter_model.hh4547logplain
-rw-r--r--neuron.cc57539logplain
-rw-r--r--neuron.hh12618logplain
-rw-r--r--nibr.cc82009logplain
-rw-r--r--nibr.hh1724logplain
-rw-r--r--nibr.m12165logplain
-rwxr-xr-xnibr3D-20050516.sh1879logplain
-rwxr-xr-xpackage.sh2340logplain
-rw-r--r--prepost_structure.cc9168logplain
-rw-r--r--prepost_structure.hh2317logplain
-rw-r--r--ramakers-branching-samples.ascii3152logplain
-rw-r--r--ramakers-turning-samples.ascii51854logplain
-rwxr-xr-xrectangle.sh1406logplain
-rwxr-xr-xrectangle_and_electrodes.sh1403logplain
-rw-r--r--slice.cc11371logplain
-rw-r--r--slice.hh8532logplain
-rw-r--r--spatial.cc13283logplain
-rw-r--r--spatial.hh8519logplain
-rw-r--r--state_storable.cc1482logplain
-rw-r--r--state_storable.hh1883logplain
-rw-r--r--synapse.cc5925logplain
-rw-r--r--synapse.hh6466logplain
-rwxr-xr-xsynapse_formation_model.cc19723logplain
-rw-r--r--synapse_formation_model.hh5798logplain
-rw-r--r--synapse_structure.cc1818logplain
-rw-r--r--synapse_structure.hh2487logplain
-rw-r--r--turning_models.cc19408logplain
-rw-r--r--turning_models.hh10048logplain
-rwxr-xr-xuniform_random_connectivity.sh1465logplain
-rwxr-xr-xvan_Ooyen.sh1710logplain
-rwxr-xr-xvan_Pelt.sh1709logplain
-rw-r--r--wizard.cc2724logplain
-rw-r--r--wizard.hh1188logplain