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class anillo
{
int num;
pto3D centroide;
int vert[];
anillo ()
{
this.num = 0;
centroide = null;
vert = new int[15];
}
/*Resumen de operaciones
añadir elemento
giro de numeros
ordenar anticlockwise
cambio origen
*/
void addVert (int pton)
{
if (this.num < 14) {
this.num++;
this.vert[num] = pton;
}
}
void setCentro (pto3D cide)
{
this.centroide = cide;
}
String poncentroide (MoleculaT mol)
{
String st = "";
pto3D ncide = new pto3D ();
for (int i = 1; i <= num; i++) {
Atomo at = (Atomo) mol.susatomos.get (this.vert[i]);
ncide = ncide.mas (at.vert);
st = st + "\n" + ncide.aTexto ();
}
centroide = ncide.escala (1 / (double) num);
return st;
}
void centracentroide (MoleculaT mol)
{
pto3D ncide = new pto3D ();
for (int i = 1; i <= num; i++) {
Atomo at = (Atomo) mol.susatomos.get (this.vert[i]);
ncide = ncide.mas (at.vert);
}
ncide.escala (1 / num);
if (ncide.dista (this.centroide) < 0.7)
centroide = ncide;
}
void ordena (pto3D vecref, MoleculaT mol) //vector de referencia y molecula a la que pertenecen (con toda informacion 3D
{
//creamos un vector que nos indique donde esta el exterior del tubo, y desde donde miramos
pto3D ciderel = centroide.menos (mol.TEST1);
pto3D vtop = ciderel.proyeccplano (mol.TESTC);
//Buscamos atomo mas cercano por la derecha
int dcha = 0;
double dis = 10;
for (int i = 1; i <= num; i++) {
Atomo at = (Atomo) mol.susatomos.get (vert[i]);
pto3D p = at.vert;
pto3D a = p.menos (centroide).menos (vecref);
double di = vecref.dista (p.menos (centroide));
double dh = a.dihedrog (vecref, vtop);
if (di < dis && dh > 30 && dh < 150) {
dis = di;
dcha = i;
}
}
this.ordenaccw (vert[dcha], mol);
}
void ordenaccw (int ini, MoleculaT mol) //vector de referencia y molecula a la que pertenecen (con toda informacion 3D
{
int newvert[] = new int[num + 1];
//creamos un vector que nos indique donde esta el exterior del tubo, y desde donde miramos
pto3D ciderel = centroide.menos (mol.TEST1);
pto3D vtop = ciderel.proyeccplano (mol.TESTC);
//Comenzamos por el atomo de inicio
newvert[1] = ini;
for (int i = 2; i <= num; i++) {
pto3D pobj = ((Atomo) mol.susatomos.get (newvert[i - 1])).vert;
int nizq = 0;
double dihedrotemp = 0;
double distan = 10;
for (int j = 1; j <= num; j++) {
Atomo at = (Atomo) mol.susatomos.get (vert[j]);
pto3D c = at.vert;
pto3D a = c.menos (pobj);
pto3D b = pobj.menos (centroide);
double dist = a.modulo ();
double dhdr = a.dihedrog (b, vtop);
if (dist < distan && dist > 0.01 && dhdr > -150 && dhdr < -30) {
distan = dist;
nizq = j;
dihedrotemp = dhdr;
}
}
newvert[i] = vert[nizq];
}
for (int i = 1; i <= num; i++)
vert[i] = newvert[i];
}
void ordenacw (int ini, MoleculaT mol) //vector de referencia y molecula a la que pertenecen (con toda informacion 3D
{
int newvert[] = new int[num + 1];
//creamos un vector que nos indique donde esta el exterior del tubo, y desde donde miramos
pto3D ciderel = centroide.menos (mol.TEST1);
pto3D vtop = ciderel.proyeccplano (mol.TESTC);
//Comenzamos por el atomo de inicio
newvert[1] = ini;
for (int i = 2; i <= num; i++) {
pto3D pobj = ((Atomo) mol.susatomos.get (newvert[i - 1])).vert;
int nizq = 0;
double dihedrotemp = 0;
double distan = 10;
for (int j = 1; j <= num; j++) {
pto3D c = ((Atomo) mol.susatomos.get (vert[j])).vert;
pto3D a = c.menos (pobj);
pto3D b = pobj.menos (centroide);
double dist = a.modulo ();
double dhdr = a.dihedrog (b, vtop);
if (dist < distan && dist > 0.01 && dhdr < 150 && dhdr > 30) {
distan = dist;
nizq = j;
dihedrotemp = dhdr;
}
}
newvert[i] = vert[nizq];
}
for (int i = 1; i <= num; i++)
vert[i] = newvert[i];
}
void rota (int giro) //pasa los indices hacia abajo(si giro>0), con lo que se cambia la orientación ccw)
{
int newvert[] = new int[num + 1];
for (int i = 1; i <= num; i++) {
int nuevapos = i - giro;
if (nuevapos > num && nuevapos < 2 * num)
nuevapos = nuevapos - num;
else if (nuevapos <= 0 && nuevapos > -num)
nuevapos = nuevapos + num;
newvert[i] = vert[nuevapos];
}
for (int i = 1; i <= num; i++)
vert[i] = newvert[i];
}
String aCadena ()
{
String cad = "Miembros: ";
for (int i = 1; i <= num; i++)
cad = cad + " " + vert[i];
if (centroide != null)
cad = cad + " centroide en " + centroide.aTexto ();
return cad;
}
}
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