1 1 300 db4.dat ALANINE ALA ALA INT 1 CORR NOMI DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.000 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.000 90.000 0.000 0.00000 4 HN1 H3 M 3 2 1 1.000 90.000 180.000 0.33000 5 N N3 M 4 3 2 1.010 90.000 180.000 -0.30000 6 HN2 H3 E 5 4 3 1.010 111.800 60.000 0.33000 7 HN3 H3 E 5 4 3 1.010 111.800 -60.000 0.33000 8 CA CH M 5 4 3 1.449 121.900 180.000 0.31000 9 CB C3 E 8 5 4 1.525 111.100 60.000 0.00000 10 C C M 8 5 4 1.522 111.100 180.000 0.50000 11 O O E 10 8 5 1.229 120.500 0.000 -0.50000 IMPROPER CA +M C O CB CA N C DONE GLYCINE GLY GLY INT 1 CORR NOMI DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.000 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.000 90.000 0.000 0.00000 4 HN1 H3 M 3 2 1 1.000 90.000 180.000 0.33000 5 N N3 M 4 3 2 1.010 90.000 180.000 -0.30000 6 HN2 H3 E 5 4 3 1.010 111.800 60.000 0.33000 7 HN3 H3 E 5 4 3 1.010 111.800 -60.000 0.33000 8 CA CQ M 5 4 3 1.449 121.900 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0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.000 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.000 90.000 0.000 0.00000 4 HN1 H3 M 3 2 1 1.000 90.000 180.000 0.33000 5 N N3 M 4 3 2 1.010 90.000 180.000 -0.30000 6 HN2 H3 E 5 4 3 1.010 111.800 60.000 0.33000 7 HN3 H3 E 5 4 3 1.010 111.800 -60.000 0.33000 8 CA CH M 5 4 3 1.449 121.900 180.000 0.31000 9 CB C2 S 8 5 4 1.525 111.100 60.000 0.00000 10 CG CA S 9 8 5 1.510 109.470 180.000 0.00000 11 CD1 CD S 10 9 8 1.400 120.000 180.000 0.00000 12 CE1 CD S 11 10 9 1.400 120.000 180.000 0.00000 13 CZ CA B 12 11 10 1.400 120.000 0.000 0.26500 14 OH OH S 13 12 11 1.360 120.000 180.000 -0.70000 15 HOH HO E 14 13 12 0.960 113.000 0.000 0.43500 16 CE2 CD S 13 12 11 1.400 120.000 0.000 0.00000 17 CD2 CD E 16 13 12 1.400 120.000 0.000 0.00000 18 C C M 8 5 4 1.522 111.100 180.000 0.50000 19 O O E 18 8 5 1.229 120.500 0.000 -0.50000 IMPROPER CA +M C O CB CA N C LOOP CG CD2 DONE GLUTAMIC ACID GLU GLU INT 1 CORR NOMI DU BEG 0.00000 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120.500 0.000 -0.50000 IMPROPER CA +M C O CB CA N C -M CA N CD LOOP CB CA DONE CYSTEINE CYS CYS INT 1 CORR NOMI DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.000 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.000 90.000 0.000 0.00000 4 HN1 H3 M 3 2 1 1.000 90.000 180.000 0.33000 5 N N3 M 4 3 2 1.010 90.000 180.000 -0.30000 6 HN2 H3 E 5 4 3 1.010 111.800 60.000 0.33000 7 HN3 H3 E 5 4 3 1.010 111.800 -60.000 0.33000 8 CA CH M 5 4 3 1.449 121.900 180.000 0.31000 9 CB C2 S 8 5 4 1.525 111.100 60.000 0.18000 10 SG SH S 9 8 5 1.810 116.000 180.000 -0.45000 11 HG HS E 10 9 8 1.330 96.000 180.000 0.27000 12 C C M 8 5 4 1.522 111.100 180.000 0.50000 13 O O E 12 8 5 1.229 120.500 0.000 -0.50000 IMPROPER CA +M C O CB CA N C DONE CYSTINE(S-S BRIDGE) CYX CYX INT 1 CORR NOMI DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.000 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.000 90.000 0.000 0.00000 4 HN1 H3 M 3 2 1 1.000 90.000 180.000 0.33000 5 N N3 M 4 3 2 1.010 90.000 180.000 -0.30000 6 HN2 H3 E 5 4 3 1.010 111.800 60.000 0.33000 7 HN3 H3 E 5 4 3 1.010 111.800 -60.000 0.33000 8 CA CH M 5 4 3 1.449 121.900 180.000 0.31000 9 CB CQ S 8 5 4 1.525 111.100 60.000 0.30000 10 SG S E 9 8 5 1.810 116.000 180.000 -0.30000 11 C C M 8 5 4 1.522 111.100 180.000 0.50000 12 O O E 11 8 5 1.229 120.500 0.000 -0.50000 IMPROPER CA +M C O CB CA N C DONE METHIONINE MET MET INT 1 CORR NOMI DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.000 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.000 90.000 0.000 0.00000 4 HN1 H3 M 3 2 1 1.000 90.000 180.000 0.33000 5 N N3 M 4 3 2 1.010 90.000 180.000 -0.30000 6 HN2 H3 E 5 4 3 1.010 111.800 60.000 0.33000 7 HN3 H3 E 5 4 3 1.010 111.800 -60.000 0.33000 8 CA CH M 5 4 3 1.449 121.900 180.000 0.31000 9 CB C2 S 8 5 4 1.525 111.100 60.000 0.00000 10 CG CQ S 9 8 5 1.525 109.470 180.000 0.23500 11 SD S S 10 9 8 1.810 110.000 180.000 -0.47000 12 CE CW E 11 10 9 1.780 100.000 180.000 0.23500 13 C C M 8 5 4 1.522 111.100 180.000 0.50000 14 O O E 13 8 5 1.229 120.500 0.000 -0.50000 IMPROPER CA +M C O CB CA N C DONE ARGININE ARG ARG INT 1 CORR NOMI DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.000 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.000 90.000 0.000 0.00000 4 HN1 H3 M 3 2 1 1.000 90.000 180.000 0.33000 5 N N3 M 4 3 2 1.010 90.000 180.000 -0.30000 6 HN2 H3 E 5 4 3 1.010 111.800 60.000 0.33000 7 HN3 H3 E 5 4 3 1.010 111.800 -60.000 0.33000 8 CA CH M 5 4 3 1.449 121.900 180.000 0.31000 9 CB C2 S 8 5 4 1.525 111.100 60.000 0.00000 10 CG C2 S 9 8 5 1.525 109.470 180.000 0.08000 11 CD C2 S 10 9 8 1.525 109.470 180.000 0.30000 12 NE N2 B 11 10 9 1.480 111.000 180.000 -0.70000 13 HNE H3 E 12 11 10 1.010 118.500 0.000 0.44000 14 CZ C B 12 11 10 1.330 123.000 180.000 0.64000 15 NH1 N2 B 14 12 11 1.330 122.000 0.000 -0.80000 16 HN11 H3 E 15 14 12 1.010 119.800 0.000 0.46000 17 HN12 H3 E 15 14 12 1.010 119.800 180.000 0.46000 18 NH2 N2 B 14 12 11 1.330 118.000 180.000 -0.80000 19 HN21 H3 E 18 14 12 1.010 119.800 0.000 0.46000 20 HN22 H3 E 18 14 12 1.010 119.800 180.000 0.46000 21 C C M 8 5 4 1.522 111.100 180.000 0.50000 22 O O E 21 8 5 1.229 120.500 0.000 -0.50000 IMPROPER CA +M C O CB CA N C NE NH1 CZ NH2 DONE HISTIDINE DELTAH, ALL ATOM AROMATIC PARAMETERS HID HID INT 1 CORR NOMI DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.000 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.000 90.000 0.000 0.00000 4 HN1 H3 M 3 2 1 1.000 90.000 180.000 0.33000 5 N N3 M 4 3 2 1.010 90.000 180.000 -0.30000 6 HN2 H3 E 5 4 3 1.010 111.800 60.000 0.33000 7 HN3 H3 E 5 4 3 1.010 111.800 -60.000 0.33000 8 CA CH M 5 4 3 1.449 121.900 180.000 0.31000 9 CB C2 S 8 5 4 1.525 111.100 60.000 0.11500 10 CG CK S 9 8 5 1.510 115.000 180.000 0.01500 11 ND1 NA B 10 9 8 1.390 122.000 180.000 -0.57000 12 HND H E 11 10 9 1.010 126.000 0.000 0.42000 13 CE1 CK B 11 10 9 1.320 108.000 180.000 0.29500 14 HE HK E 13 11 10 1.090 120.000 180.000 0.11500 15 NE2 NB S 13 11 10 1.310 109.000 0.000 -0.49000 16 CD2 CK S 15 13 11 1.360 110.000 0.000 -0.01500 17 HD HK E 16 15 13 1.090 120.000 180.000 0.11500 18 C C M 8 5 4 1.522 111.100 180.000 0.50000 19 O O E 18 8 5 1.229 120.500 0.000 -0.50000 IMPROPER CA +M C O CB CA N C CG CE1 ND1 HND LOOP CG CD2 DONE HISTIDINE EPSILONH, ALL ATOM AROMATIC PARAMETERS HIE HIE INT 1 CORR NOMI DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.000 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.000 90.000 0.000 0.00000 4 HN1 H3 M 3 2 1 1.000 90.000 180.000 0.33000 5 N N3 M 4 3 2 1.010 90.000 180.000 -0.30000 6 HN2 H3 E 5 4 3 1.010 111.800 60.000 0.33000 7 HN3 H3 E 5 4 3 1.010 111.800 -60.000 0.33000 8 CA CH M 5 4 3 1.449 121.900 180.000 0.31000 9 CB C2 S 8 5 4 1.525 111.100 60.000 0.11500 10 CG CK S 9 8 5 1.510 115.000 180.000 -0.01500 11 ND1 NB S 10 9 8 1.390 122.000 180.000 -0.49000 12 CE1 CK B 11 10 9 1.320 108.000 180.000 0.29500 13 HE HK E 12 11 10 1.090 120.000 180.000 0.11500 14 NE2 NA B 12 11 10 1.310 109.000 0.000 -0.57000 15 HNE H E 14 12 11 1.010 125.000 180.000 0.42000 16 CD2 CK S 14 12 11 1.360 110.000 0.000 0.01500 17 HD HK E 16 14 12 1.090 120.000 180.000 0.11500 18 C C M 8 5 4 1.522 111.100 180.000 0.50000 19 O O E 18 8 5 1.229 120.500 0.000 -0.50000 IMPROPER CA +M C O CB CA N C CE1 CD2 NE2 HNE LOOP CG CD2 DONE HISTIDINE PLUS, ALL ATOM AROMATIC PARAMETERS HIP HIP INT 1 CORR NOMI DU BEG 0.000000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.000 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.000 90.000 0.000 0.00000 4 HN1 H3 M 3 2 1 1.000 90.000 180.000 0.33000 5 N N3 M 4 3 2 1.010 90.000 180.000 -0.30000 6 HN2 H3 E 5 4 3 1.010 111.800 60.000 0.33000 7 HN3 H3 E 5 4 3 1.010 111.800 -60.000 0.33000 8 CA CH M 5 4 3 1.4490 121.9000 180.0000 0.31000 9 CB C2 S 8 5 4 1.5250 111.1000 60.0000 0.11500 10 CG CK S 9 8 5 1.5100 115.0000 180.0000 0.21500 11 ND1 NA B 10 9 8 1.3900 122.0000 180.0000 -0.54000 12 HND H E 11 10 9 1.0100 126.0000 0.0000 0.46000 13 CE1 CK B 11 10 9 1.3200 108.0000 180.0000 0.38500 14 HE HK E 13 11 10 1.090 120.000 180.000 0.11500 15 NE2 NA B 13 11 10 1.3100 109.0000 0.0000 -0.54000 16 HNE H E 15 13 11 1.0100 125.0000 180.0000 0.46000 17 CD2 CK S 15 13 11 1.3600 110.0000 0.0000 0.21500 18 HD HK E 17 15 13 1.090 120.000 180.000 0.11500 19 C C M 8 5 4 1.5220 111.1000 180.0000 0.50000 20 O O E 19 8 5 1.2290 120.5000 0.0000 -0.50000 IMPROPER CA +M C O CB CA N C CG CE1 ND1 HND CE1 CD2 NE2 HNE LOOP CG CD2 DONE TRYPTOPHAN, ALL ATOM AROMATIC PARAMETERS TRP TRP INT 1 CORR NOMI DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.000 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.000 90.000 0.000 0.00000 4 HN1 H3 M 3 2 1 1.000 90.000 180.000 0.33000 5 N N3 M 4 3 2 1.010 90.000 180.000 -0.30000 6 HN2 H3 E 5 4 3 1.010 111.800 60.000 0.33000 7 HN3 H3 E 5 4 3 1.010 111.800 -60.000 0.33000 8 CA CH M 5 4 3 1.449 121.900 180.000 0.31000 9 CB C2 S 8 5 4 1.525 111.100 60.000 0.11500 10 CG CK S 9 8 5 1.510 115.000 180.000 -0.17000 11 CD1 CK B 10 9 8 1.340 127.000 180.000 0.01500 12 HD HK E 11 10 9 1.090 120.000 0.000 0.11500 13 NE1 NA B 11 10 9 1.430 107.000 180.000 -0.57000 14 HNE H E 13 11 10 1.010 125.500 180.000 0.42000 15 CE2 CN S 13 11 10 1.310 109.000 0.000 0.13000 16 CZ2 CK B 15 13 11 1.400 128.000 180.000 -0.11500 17 HZ1 HK E 16 15 13 1.090 120.000 0.000 0.11500 18 CH2 CK B 16 15 13 1.390 116.000 180.000 -0.11500 19 HH HK E 18 16 15 1.090 120.000 180.000 0.11500 20 CZ3 CK B 18 16 15 1.350 121.000 0.000 -0.11500 21 HZ2 HK E 20 18 16 1.090 120.000 180.000 0.11500 22 CE3 CK B 20 18 16 1.410 122.000 0.000 -0.11500 23 HE HK E 22 20 18 1.090 120.000 180.000 0.11500 24 CD2 CB E 22 20 18 1.400 117.000 0.000 -0.05500 25 C C M 8 5 4 1.522 111.100 180.000 0.50000 26 O O E 25 8 5 1.229 120.500 0.000 -0.50000 IMPROPER CA +M C O CB CA N C CD1 CE2 NE1 HNE CE2 CH2 CZ2 HZ1 CZ2 CZ3 CH2 HH CH2 CE3 CZ3 HZ2 CZ3 CD2 CE3 HE LOOP CG CD2 CE2 CD2 DONE HISTIDINE DELTAH, UNITED ATOM AROMATIC PARAMETERS HDU HDU INT 1 CORR NOMI DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.000 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.000 90.000 0.000 0.00000 4 HN1 H3 M 3 2 1 1.000 90.000 180.000 0.33000 5 N N3 M 4 3 2 1.010 90.000 180.000 -0.30000 6 HN2 H3 E 5 4 3 1.010 111.800 60.000 0.33000 7 HN3 H3 E 5 4 3 1.010 111.800 -60.000 0.33000 8 CA CH M 5 4 3 1.449 121.900 180.000 0.31000 9 CB C2 S 8 5 4 1.525 111.100 60.000 0.00000 10 CG CC S 9 8 5 1.510 115.000 180.000 0.13000 11 ND1 NA B 10 9 8 1.390 122.000 180.000 -0.57000 12 HND H E 11 10 9 1.010 126.000 0.000 0.42000 13 CE1 CP S 11 10 9 1.320 108.000 180.000 0.41000 14 NE2 NB S 13 11 10 1.310 109.000 0.000 -0.49000 15 CD2 CF E 14 13 11 1.360 110.000 0.000 0.10000 16 C C M 8 5 4 1.522 111.100 180.000 0.50000 17 O O E 16 8 5 1.229 120.500 0.000 -0.50000 IMPROPER CA +M C O CB CA N C LOOP CG CD2 DONE HISTIDINE EPSILONH, UNITED ATOM AROMATIC PARAMETERS HEU HEU INT 1 CORR NOMI DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.000 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.000 90.000 0.000 0.00000 4 HN1 H3 M 3 2 1 1.000 90.000 180.000 0.33000 5 N N3 M 4 3 2 1.010 90.000 180.000 -0.30000 6 HN2 H3 E 5 4 3 1.010 111.800 60.000 0.33000 7 HN3 H3 E 5 4 3 1.010 111.800 -60.000 0.33000 8 CA CH M 5 4 3 1.449 121.900 180.000 0.31000 9 CB C2 S 8 5 4 1.525 111.100 60.000 0.00000 10 CG CC S 9 8 5 1.510 115.000 180.000 0.10000 11 ND1 NB S 10 9 8 1.390 122.000 180.000 -0.49000 12 CE1 CP S 11 10 9 1.320 108.000 180.000 0.41000 13 NE2 NA B 12 11 10 1.310 109.000 0.000 -0.57000 14 HNE H E 13 12 11 1.010 125.000 180.000 0.42000 15 CD2 CG E 13 12 11 1.360 110.000 0.000 0.13000 16 C C M 8 5 4 1.522 111.100 180.000 0.50000 17 O O E 16 8 5 1.229 120.500 0.000 -0.50000 IMPROPER CA +M C O CB CA N C LOOP CG CD2 DONE HISTIDINE PLUS, UNITED ATOM AROMATIC PARAMETERS HPU HPU INT 1 CORR NOMI DU BEG 0.000000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.000 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.000 90.000 0.000 0.00000 4 HN1 H3 M 3 2 1 1.000 90.000 180.000 0.33000 5 N N3 M 4 3 2 1.010 90.000 180.000 -0.30000 6 HN2 H3 E 5 4 3 1.010 111.800 60.000 0.33000 7 HN3 H3 E 5 4 3 1.010 111.800 -60.000 0.33000 8 CA CH M 5 4 3 1.4490 121.9000 180.0000 0.31000 9 CB C2 S 8 5 4 1.5250 111.1000 60.0000 0.00000 10 CG CC S 9 8 5 1.5100 115.0000 180.0000 0.33000 11 ND1 NA B 10 9 8 1.3900 122.0000 180.0000 -0.54000 12 HND H E 11 10 9 1.0100 126.0000 0.0000 0.46000 13 CE1 CP S 11 10 9 1.3200 108.0000 180.0000 0.50000 14 NE2 NA B 13 11 10 1.3100 109.0000 0.0000 -0.54000 15 HNE H E 14 13 11 1.0100 125.0000 180.0000 0.46000 16 CD2 CG E 14 13 11 1.3600 110.0000 0.0000 0.33000 17 C C M 8 5 4 1.5220 111.1000 180.0000 0.50000 18 O O E 17 8 5 1.2290 120.5000 0.0000 -0.50000 IMPROPER CA +M C O CB CA N C LOOP CG CD2 DONE TRYPTOPHAN, UNITED ATOM AROMATIC PARAMETERS TRU TRU INT 1 CORR NOMI DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.000 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.000 90.000 0.000 0.00000 4 HN1 H3 M 3 2 1 1.000 90.000 180.000 0.33000 5 N N3 M 4 3 2 1.010 90.000 180.000 -0.30000 6 HN2 H3 E 5 4 3 1.010 111.800 60.000 0.33000 7 HN3 H3 E 5 4 3 1.010 111.800 -60.000 0.33000 8 CA CH M 5 4 3 1.449 121.900 180.000 0.31000 9 CB C2 S 8 5 4 1.525 111.100 60.000 0.00000 10 CG C* S 9 8 5 1.510 115.000 180.000 -0.05500 11 CD1 CG S 10 9 8 1.340 127.000 180.000 0.13000 12 NE1 NA B 11 10 9 1.430 107.000 180.000 -0.57000 13 HNE H E 12 11 10 1.010 125.500 180.000 0.42000 14 CE2 CN S 12 11 10 1.310 109.000 0.000 0.13000 15 CZ2 CD S 14 12 11 1.400 128.000 180.000 0.00000 16 CH2 CD S 15 14 12 1.390 116.000 180.000 0.00000 17 CZ3 CD S 16 15 14 1.350 121.000 0.000 0.00000 18 CE3 CD S 17 16 15 1.410 122.000 0.000 0.00000 19 CD2 CB E 18 17 16 1.400 117.000 0.000 -0.05500 20 C C M 8 5 4 1.522 111.100 180.000 0.50000 21 O O E 20 8 5 1.229 120.500 0.000 -0.50000 IMPROPER CA +M C O CB CA N C LOOP CG CD2 CE2 CD2 DONE STOP