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CB C2 S 6 4 3 1.525 111.100 60.000 0.00000 8 CG C2 S 7 6 4 1.510 109.470 180.000 -0.10000 9 CD C B 8 7 6 1.527 109.470 180.000 0.70000 10 OE1 O2 E 9 8 7 1.260 117.200 90.000 -0.80000 11 OE2 O2 E 9 8 7 1.260 117.200 270.000 -0.80000 12 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.50000 13 O O E 12 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.50000 IMPROPER -M CA N HN CA +M C O CB CA N C CG OE1 CD OE2 DONE ASPARTIC ACID ASP ASP INT 1 CORR OMIT DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000 4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.57000 5 HN H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.37000 6 CA CH M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 0.20000 7 CB C2 S 6 4 3 1.525 111.100 60.000 -0.10000 8 CG C B 7 6 4 1.527 109.470 180.000 0.70000 9 OD1 O2 E 8 7 6 1.260 117.200 90.000 -0.80000 10 OD2 O2 E 8 7 6 1.260 117.200 270.000 -0.80000 11 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.50000 12 O O E 11 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.50000 IMPROPER -M CA N HN CA +M C O CB CA N C CB OD1 CG OD2 DONE LYSINE LYS LYS INT 1 CORR OMIT DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000 4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.57000 5 HN H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.37000 6 CA CH M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 0.20000 7 CB C2 S 6 4 3 1.525 111.100 60.000 0.00000 8 CG C2 S 7 6 4 1.525 109.470 180.000 0.00000 9 CD C2 S 8 7 6 1.525 109.470 180.000 0.00000 10 CE C2 S 9 8 7 1.525 109.470 180.000 0.31000 11 NZ N3 3 10 9 8 1.470 109.470 180.000 -0.30000 12 HNZ1 H3 E 11 10 9 1.010 109.470 60.000 0.33000 13 HNZ2 H3 E 11 10 9 1.010 109.470 180.000 0.33000 14 HNZ3 H3 E 11 10 9 1.010 109.470 300.000 0.33000 15 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.50000 16 O O E 15 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.50000 IMPROPER -M CA N HN CA +M C O CB CA N C DONE PROLINE PRO PRO INT 1 CORR OMIT DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000 4 N N M 3 2 1 1.337 117.000 180.000 -0.57000 5 CD CQ S 4 3 2 1.458 126.100 356.100 0.28500 6 CG C2 S 5 4 3 1.500 103.200 200.100 0.00000 7 CB C2 E 6 5 4 1.510 106.000 338.300 0.00000 8 CA CH M 4 3 2 1.451 120.600 175.200 0.28500 9 C C M 8 4 3 1.522 111.100 0.000 0.50000 10 O O E 9 8 4 1.229 120.500 0.000 -0.50000 IMPROPER CA +M C O CB CA N C -M CA N CD LOOP CB CA DONE CYSTEINE CYS CYS INT 1 CORR OMIT DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000 4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.57000 5 HN H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.37000 6 CA CH M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 0.20000 7 CB C2 S 6 4 3 1.525 111.100 60.000 0.18000 8 SG SH S 7 6 4 1.810 116.000 180.000 -0.45000 9 HG HS E 8 7 6 1.330 96.000 180.000 0.27000 10 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.50000 11 O O E 10 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.50000 IMPROPER -M CA N HN CA +M C O CB CA N C DONE CYSTINE(S-S BRIDGE) CYX CYX INT 1 CORR OMIT DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000 4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.57000 5 HN H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.37000 6 CA CH M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 0.20000 7 CB CQ S 6 4 3 1.525 111.100 60.000 0.30000 8 SG S E 7 6 4 1.810 116.000 180.000 -0.30000 9 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.50000 10 O O E 9 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.50000 IMPROPER -M CA N HN CA +M C O CB CA N C DONE METHIONINE MET MET INT 1 CORR OMIT DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000 4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.57000 5 HN H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.37000 6 CA CH M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 0.20000 7 CB C2 S 6 4 3 1.525 111.100 60.000 0.00000 8 CG CQ S 7 6 4 1.525 109.470 180.000 0.23500 9 SD S S 8 7 6 1.810 110.000 180.000 -0.47000 10 CE CW E 9 8 7 1.780 100.000 180.000 0.23500 11 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.50000 12 O O E 11 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.50000 IMPROPER -M CA N HN CA +M C O CB CA N C DONE O MINUS END ATOM OME OME INT 1 CORR OMIT DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.000 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.000 90.000 0.000 0.00000 4 OXT O2 E 3 2 1 1.260 117.200 180.000 -0.80000 DONE ACE BEGINNING GROUP ACE ACE INT 1 CORR NOMI DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.000 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.000 90.000 0.000 0.00000 4 CH3 C3 M 3 2 1 1.000 90.000 180.000 0.00000 5 C C M 4 3 2 1.530 111.100 180.000 0.50000 6 O O E 5 4 3 1.229 120.500 0.000 -0.50000 IMPROPER CH3 +M C O DONE WATER, TIP3P MODEL WT3 WT3 INT 1 CORR OMIT DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.000 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.000 90.000 0.000 0.00000 4 HW1 HT M 3 2 1 1.000 101.430 -98.890 0.41700 5 OW OT M 4 3 2 0.9572 104.520 -39.220 -0.83400 6 HW2 HT E 5 4 3 0.9572 104.520 -151.000 0.41700 DONE WATER, TIP4P MODEL WT4 WT4 INT 1 CORR OMIT DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.000 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.000 90.000 0.000 0.00000 4 HW1 H4 M 3 2 1 1.000 101.430 -98.890 0.52000 5 OW O4 M 4 3 2 0.9572 104.520 -39.220 0.00000 6 HW2 H4 E 5 4 3 0.9572 104.520 -151.000 0.52000 7 M M4 E 5 4 3 0.150 52.260 -151.000 -1.04000 DONE TERMINAL METHYL AMIDE, OPLS MODEL AME AME INT 1 CORR OMIT DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000 4 NT N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.57000 5 HN H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.37000 6 CT CW E 4 3 2 1.449 121.900 180.000 0.20000 DONE ARGININE ARG ARG INT 1 CORR OMIT DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000 4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.57000 5 HN H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.37000 6 CA CH M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 0.20000 7 CB C2 S 6 4 3 1.525 111.100 60.000 0.00000 8 CG C2 S 7 6 4 1.525 109.470 180.000 0.07000 9 CD C2 S 8 7 6 1.525 109.470 180.000 0.31000 10 NE N2 B 9 8 7 1.480 111.000 180.000 -0.70000 11 HNE H3 E 10 9 8 1.010 118.500 0.000 0.44000 12 CZ C4 B 10 9 8 1.330 123.000 180.000 0.64000 13 NH1 N2 B 12 10 9 1.330 122.000 0.000 -0.80000 14 HN11 H3 E 13 12 10 1.010 119.800 0.000 0.46000 15 HN12 H3 E 13 12 10 1.010 119.800 180.000 0.46000 16 NH2 N2 B 12 10 9 1.330 118.000 180.000 -0.80000 17 HN21 H3 E 16 12 10 1.010 119.800 0.000 0.46000 18 HN22 H3 E 16 12 10 1.010 119.800 180.000 0.46000 19 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.50000 20 O O E 19 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.50000 IMPROPER -M CA N HN CA +M C O CB CA N C NE NH1 CZ NH2 DONE HISTIDINE DELTAH, ALL ATOM AROMATIC PARAMETERS HID HID INT 1 CORR OMIT DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000 4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.57000 5 HN H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.37000 6 CA CH M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 0.20000 7 CB C2 S 6 4 3 1.525 111.100 60.000 0.11500 8 CG CK S 7 6 4 1.510 115.000 180.000 0.01500 9 ND1 NA B 8 7 6 1.390 122.000 180.000 -0.57000 10 HND H E 9 8 7 1.010 126.000 0.000 0.42000 11 CE1 CK B 9 8 7 1.320 108.000 180.000 0.29500 12 HE HK E 11 9 8 1.090 120.000 180.000 0.11500 13 NE2 NB S 11 9 8 1.310 109.000 0.000 -0.49000 14 CD2 CK S 13 11 9 1.360 110.000 0.000 -0.01500 15 HD HK E 14 13 11 1.090 120.000 180.000 0.11500 16 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.50000 17 O O E 16 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.50000 IMPROPER -M CA N HN CA +M C O CB CA N C CG CE1 ND1 HND LOOP CG CD2 DONE HISTIDINE EPSILONH, ALL ATOM AROMATIC PARAMETERS HIE HIE INT 1 CORR OMIT DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000 4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.57000 5 HN H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.37000 6 CA CH M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 0.20000 7 CB C2 S 6 4 3 1.525 111.100 60.000 0.11500 8 CG CK S 7 6 4 1.510 115.000 180.000 -0.01500 9 ND1 NB S 8 7 6 1.390 122.000 180.000 -0.49000 10 CE1 CK B 9 8 7 1.320 108.000 180.000 0.29500 11 HE HK E 10 9 8 1.090 120.000 180.000 0.11500 12 NE2 NA B 10 9 8 1.310 109.000 0.000 -0.57000 13 HNE H E 12 10 9 1.010 125.000 180.000 0.42000 14 CD2 CK S 12 10 9 1.360 110.000 0.000 0.01500 15 HD HK E 14 12 10 1.090 120.000 180.000 0.11500 16 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.50000 17 O O E 16 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.50000 IMPROPER -M CA N HN CA +M C O CB CA N C CE1 CD2 NE2 HNE LOOP CG CD2 DONE HISTIDINE PLUS, ALL ATOM AROMATIC PARAMETERS HIP HIP INT 1 CORR OMIT DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000 4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.57000 5 HN H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.37000 6 CA CH M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 0.20000 7 CB C2 S 6 4 3 1.525 111.100 60.000 0.11500 8 CG CK S 7 6 4 1.510 115.000 180.000 0.21500 9 ND1 NA B 8 7 6 1.390 122.000 180.000 -0.54000 10 HND H E 9 8 7 1.010 126.000 0.000 0.46000 11 CE1 CK B 9 8 7 1.320 108.000 180.000 0.38500 12 HE HK E 11 9 8 1.090 120.000 180.000 0.11500 13 NE2 NA B 11 9 8 1.310 109.000 0.000 -0.54000 14 HNE H E 13 11 9 1.010 125.000 180.000 0.46000 15 CD2 CK S 13 11 9 1.360 110.000 0.000 0.21500 16 HD HK E 15 13 11 1.090 120.000 180.000 0.11500 17 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.50000 18 O O E 17 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.50000 IMPROPER -M CA N HN CA +M C O CB CA N C CG CE1 ND1 HND CE1 CD2 NE2 HNE LOOP CG CD2 DONE TRYPTOPHAN, ALL ATOM AROMATIC PARAMETERS TRP TRP INT 1 CORR OMIT DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000 4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.57000 5 HN H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.37000 6 CA CH M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 0.20000 7 CB C2 S 6 4 3 1.525 111.100 60.000 0.11500 8 CG CK S 7 6 4 1.510 115.000 180.000 -0.17000 9 CD1 CK B 8 7 6 1.340 127.000 180.000 0.01500 10 HD HK E 9 8 7 1.090 120.000 0.000 0.11500 11 NE1 NA B 9 8 7 1.430 107.000 180.000 -0.57000 12 HNE H E 11 9 8 1.010 125.500 180.000 0.42000 13 CE2 CN S 11 9 8 1.310 109.000 0.000 0.13000 14 CZ2 CK B 13 11 9 1.400 128.000 180.000 -0.11500 15 HZ1 HK E 14 13 11 1.090 120.000 0.000 0.11500 16 CH2 CK B 14 13 11 1.390 116.000 180.000 -0.11500 17 HH HK E 16 14 13 1.090 120.000 180.000 0.11500 18 CZ3 CK B 16 14 13 1.350 121.000 0.000 -0.11500 19 HZ2 HK E 18 16 14 1.090 120.000 180.000 0.11500 20 CE3 CK B 18 16 14 1.410 122.000 0.000 -0.11500 21 HE HK E 20 18 16 1.090 120.000 180.000 0.11500 22 CD2 CB E 20 18 16 1.400 117.000 0.000 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0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000 4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.57000 5 HN H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.37000 6 CA CH M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 0.20000 7 CB C2 S 6 4 3 1.525 111.100 60.000 0.00000 8 CG CC S 7 6 4 1.510 115.000 180.000 0.33000 9 ND1 NA B 8 7 6 1.390 122.000 180.000 -0.54000 10 HND H E 9 8 7 1.010 126.000 0.000 0.46000 11 CE1 CP S 9 8 7 1.320 108.000 180.000 0.50000 12 NE2 NA B 11 9 8 1.310 109.000 0.000 -0.54000 13 HNE H E 12 11 9 1.010 125.000 180.000 0.46000 14 CD2 CG E 12 11 9 1.360 110.000 0.000 0.33000 15 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.50000 16 O O E 15 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.50000 IMPROPER -M CA N HN CA +M C O CB CA N C LOOP CG CD2 DONE TRYPTOPHAN, UNITED ATOM AROMATIC PARAMETERS TRU TRU INT 1 CORR OMIT DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 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1.522 111.100 0.000 0.00000 4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.57000 5 HN H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.37000 6 CA CH M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 0.20000 7 CB C3 E 6 4 3 1.525 111.100 -60.000 0.00000 8 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.50000 9 O O E 8 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.50000 IMPROPER -M CA N HN CA +M C O CB CA N C DONE STOP