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180.000 0.408312 18 HE22 H E 16 14 11 1.010 119.800 0.000 0.408312 19 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.418577 20 O O E 19 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.565310 CHARGE -0.387353 0.300605 0.037470 0.152255 -0.032112 0.030995 0.030995 -0.020264 0.030791 0.030791 0.667812 -0.628483 -0.883393 0.408312 0.408312 0.418577 -0.565310 IMPROPER -M CA N H CA +M C O CG NE2 CD OE1 CD HE21 NE2 HE22 DONE ARGININE ARG INT 1 CORR OMIT DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000 4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.300879 5 H H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.233693 6 CA CT M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 -0.131381 7 HA H1 E 6 4 3 1.090 109.500 300.000 0.053266 8 CB CT 3 6 4 3 1.525 111.100 60.000 0.036707 9 HB2 HC E 8 6 4 1.090 109.500 300.000 0.028012 10 HB3 HC E 8 6 4 1.090 109.500 60.000 0.028012 11 CG CT 3 8 6 4 1.525 109.470 180.000 0.012454 12 HG2 HC E 11 8 6 1.090 109.500 300.000 0.002964 13 HG3 HC E 11 8 6 1.090 109.500 60.000 0.002964 14 CD CT 3 11 8 6 1.525 109.470 180.000 0.126329 15 HD2 H1 E 14 11 8 1.090 109.500 300.000 0.068148 16 HD3 H1 E 14 11 8 1.090 109.500 60.000 0.068148 17 NE N2 B 14 11 8 1.480 111.000 180.000 -0.464890 18 HE H E 17 14 11 1.010 118.500 0.000 0.326274 19 CZ CA B 17 14 11 1.330 123.000 180.000 0.565543 20 NH1 N2 B 19 17 14 1.330 122.000 0.000 -0.685774 21 HH11 H E 20 19 17 1.010 119.800 0.000 0.391052 22 HH12 H E 20 19 17 1.010 119.800 180.000 0.391052 23 NH2 N2 B 19 17 14 1.330 118.000 180.000 -0.685774 24 HH21 H E 23 19 17 1.010 119.800 0.000 0.391052 25 HH22 H E 23 19 17 1.010 119.800 180.000 0.391052 26 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.730308 27 O O E 26 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.578332 CHARGE -0.300879 0.233693 -0.131381 0.053266 0.036707 0.028012 0.028012 0.012454 0.002964 0.002964 0.126329 0.068148 0.068148 -0.464890 0.326274 0.565543 -0.685774 0.391052 0.391052 -0.685774 0.391052 0.391052 0.730308 -0.578332 IMPROPER -M CA N H CA +M C O NE NH1 CZ NH2 CD CZ NE HE CZ HH11 NH1 HH12 CZ HH21 NH2 HH22 DONE HISTIDINE DELTAH HID INT 1 CORR OMIT DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000 4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.506799 5 H H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.351021 6 CA CT M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 0.119066 7 HA H1 E 6 4 3 1.090 109.500 300.000 0.137761 8 CB CT 3 6 4 3 1.525 111.100 60.000 -0.122638 9 HB2 HC E 8 6 4 1.090 109.500 300.000 0.086329 10 HB3 HC E 8 6 4 1.090 109.500 60.000 0.086329 11 CG CC S 8 6 4 1.510 115.000 180.000 -0.001547 12 ND1 NA B 11 8 6 1.390 122.000 180.000 -0.205785 13 HD1 H E 12 11 8 1.010 126.000 0.000 0.318273 14 CE1 CR B 12 11 8 1.320 108.000 180.000 0.147273 15 HE1 H5 E 14 12 11 1.090 120.000 180.000 0.122182 16 NE2 NB S 14 12 11 1.310 109.000 0.000 -0.601482 17 CD2 CV S 16 14 12 1.360 110.000 0.000 0.043744 18 HD2 H4 E 17 16 14 1.090 120.000 180.000 0.110157 19 C C M 6 4 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TRYPTOPHAN TRP INT 1 CORR OMIT DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000 4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.427579 5 H H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.241716 6 CA CT M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 -0.020082 7 HA H1 E 6 4 3 1.090 109.500 300.000 0.106629 8 CB CT 3 6 4 3 1.525 111.100 60.000 -0.098364 9 HB2 HC E 8 6 4 1.090 109.500 300.000 0.065424 10 HB3 HC E 8 6 4 1.090 109.500 60.000 0.065424 11 CG C* S 8 6 4 1.510 115.000 180.000 -0.099797 12 CD1 CW B 11 8 6 1.340 127.000 180.000 -0.174053 13 HD1 H4 E 12 11 8 1.090 120.000 0.000 0.170633 14 NE1 NA B 12 11 8 1.430 107.000 180.000 -0.298433 15 HE1 H E 14 12 11 1.010 125.500 180.000 0.322375 16 CE2 CN S 14 12 11 1.310 109.000 0.000 0.141523 17 CZ2 CA B 16 14 12 1.400 128.000 180.000 -0.210701 18 HZ2 HA E 17 16 14 1.090 120.000 0.000 0.125512 19 CH2 CA B 17 16 14 1.390 116.000 180.000 -0.133022 20 HH2 HA E 19 17 16 1.090 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300.000 0.294561 24 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.725129 25 O O E 24 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.563157 CHARGE -0.435875 0.251302 -0.038773 0.129478 -0.108273 0.045214 0.045214 0.033341 0.010208 0.010208 -0.047841 0.070715 0.070715 -0.069974 0.119522 0.119522 -0.250358 0.294561 0.294561 0.294561 0.725129 -0.563157 IMPROPER -M CA N H CA +M C O DONE LYSINE neutral LYN INT 1 CORR OMIT DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000 4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.453388 5 H H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.289695 6 CA CT M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 -0.024500 7 HA H1 E 6 4 3 1.090 109.500 300.000 0.099553 8 CB CT 3 6 4 3 1.525 111.100 60.000 0.035478 9 HB2 HC E 8 6 4 1.090 109.500 300.000 0.004797 10 HB3 HC E 8 6 4 1.090 109.500 60.000 0.004797 11 CG CT 3 8 6 4 1.525 109.470 180.000 -0.019962 12 HG2 HC E 11 8 6 1.090 109.500 300.000 -0.015610 13 HG3 HC E 11 8 6 1.090 109.500 60.000 -0.015610 14 CD CT 3 11 8 6 1.525 109.470 180.000 0.041105 15 HD2 HC E 14 11 8 1.090 109.500 300.000 0.008304 16 HD3 HC E 14 11 8 1.090 109.500 60.000 0.008304 17 CE CT 3 14 11 8 1.525 109.470 180.000 0.188382 18 HE2 HP E 17 14 11 1.090 109.500 300.000 0.016810 19 HE3 HP E 17 14 11 1.090 109.500 60.000 0.016810 20 NZ N3 B 17 14 11 1.470 109.470 180.000 -0.894254 21 HZ2 H E 20 17 14 1.010 109.470 180.000 0.332053 22 HZ3 H E 20 17 14 1.010 109.470 300.000 0.332053 23 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.608464 24 O O E 24 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.563281 CHARGE -0.453388 0.289695 -0.024500 0.099553 0.035478 0.004797 0.004797 -0.019962 -0.015610 -0.015610 0.041105 0.008304 0.008304 0.188382 0.016810 0.016810 -0.894254 0.332053 0.332053 0.608464 -0.563281 IMPROPER -M CA N H CA +M C O DONE PROLINE PRO INT 1 CORR OMIT DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000 4 N N M 3 2 1 1.337 117.000 180.000 -0.088116 5 CD CT 3 4 3 2 1.458 126.100 356.100 -0.011906 6 HD2 H1 E 5 4 3 1.090 109.500 80.000 0.043951 7 HD3 H1 E 5 4 3 1.090 109.500 320.000 0.043950 8 CG CT 3 5 4 3 1.500 103.200 200.100 0.013059 9 HG2 HC E 8 5 4 1.090 109.500 218.000 0.019574 10 HG3 HC E 8 5 4 1.090 109.500 98.000 0.019574 11 CB CT B 8 5 4 1.510 106.000 338.300 -0.003351 12 HB2 HC E 11 8 5 1.090 109.500 256.300 0.019352 13 HB3 HC E 11 8 5 1.090 109.500 136.300 0.019352 14 CA CT M 4 3 2 1.451 120.600 175.200 -0.034577 15 HA H1 E 14 4 3 1.090 109.500 60.000 0.059977 16 C C M 14 4 3 1.522 109.500 300.000 0.333720 17 O O E 16 14 4 1.229 120.500 0.000 -0.434559 CHARGE -0.088116 -0.011906 0.043951 0.043950 0.013059 0.019574 0.019574 -0.003351 0.019352 0.019352 -0.034577 0.059977 0.333720 -0.434559 LOOP CB CA IMPROPER CA +M C O -M CD N CA DONE CYSTEINE CYS INT 1 CORR OMIT DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000 4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.396165 5 H H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.295187 6 CA CT M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 -0.073501 7 HA H1 E 6 4 3 1.090 109.500 300.000 0.140510 8 CB CT 3 6 4 3 1.525 111.100 60.000 -0.221371 9 HB2 H1 E 8 6 4 1.090 109.500 300.000 0.146537 10 HB3 H1 E 8 6 4 1.090 109.500 60.000 0.146537 11 SG SH S 8 6 4 1.810 116.000 180.000 -0.285182 12 HG HS E 11 8 6 1.330 96.000 180.000 0.189274 13 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.643035 14 O O E 13 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.584861 CHARGE -0.396165 0.295187 -0.073501 0.140510 -0.221371 0.146537 0.146537 -0.285182 0.189274 0.643035 -0.584861 IMPROPER -M CA N H CA +M C O DONE CYSTEINE with negative charge CYM INT 1 CORR OMIT DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000 4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.46300 5 HN H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.25200 6 CA CT M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 0.03500 7 HA H1 E 6 4 3 1.090 109.500 300.000 0.04800 8 CB CT 3 6 4 3 1.525 111.100 60.000 -0.73600 9 HB3 H1 E 8 6 4 1.090 109.500 60.000 0.24400 10 HB2 H1 E 8 6 4 1.090 109.500 300.000 0.24400 11 SG SH E 8 6 4 1.810 116.000 180.000 -0.73600 12 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.61600 13 O O E 12 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.50400 CHARGE -.4157 .2719 -.0351 .0508 -.2413 .1122 .1122 -.8844 .5973 -.5679 IMPROPER -M CA N HN CA +M C O DONE CYSTINE(S-S BRIDGE) CYX INT 1 CORR OMIT DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000 4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.435921 5 H H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.290077 6 CA CT M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 -0.030547 7 HA H1 E 6 4 3 1.090 109.500 300.000 0.132146 8 CB CT 3 6 4 3 1.525 111.100 60.000 -0.033006 9 HB2 H1 E 8 6 4 1.090 109.500 300.000 0.078951 10 HB3 H1 E 8 6 4 1.090 109.500 60.000 0.078951 11 SG S E 8 6 4 1.810 116.000 180.000 -0.132272 12 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.624788 13 O O E 12 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.573167 CHARGE -0.435921 0.290077 -0.030547 0.132146 -0.033006 0.078951 0.078951 -0.132272 0.624788 -0.573167 IMPROPER -M CA N H CA +M C O DONE METHIONINE MET INT 1 CORR OMIT DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000 4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.394918 5 H H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.280537 6 CA CT M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 -0.087681 7 HA H1 E 6 4 3 1.090 109.500 300.000 0.123080 8 CB CT 3 6 4 3 1.525 111.100 60.000 0.019227 9 HB2 HC E 8 6 4 1.090 109.500 300.000 0.048840 10 HB3 HC E 8 6 4 1.090 109.500 60.000 0.048840 11 CG CT 3 8 6 4 1.525 109.470 180.000 -0.208167 12 HG2 H1 E 11 8 6 1.090 109.500 300.000 0.124228 13 HG3 H1 E 11 8 6 1.090 109.500 60.000 0.124228 14 SD S S 11 8 6 1.810 110.000 180.000 -0.211958 15 CE CT 3 14 11 8 1.780 100.000 180.000 -0.284698 16 HE1 H1 E 15 14 11 1.090 109.500 60.000 0.128394 17 HE2 H1 E 15 14 11 1.090 109.500 180.000 0.128394 18 HE3 H1 E 15 14 11 1.090 109.500 300.000 0.128394 19 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.599684 20 O O E 19 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.566424 CHARGE -0.394918 0.280537 -0.087681 0.123080 0.019227 0.048840 0.048840 -0.208167 0.124228 0.124228 -0.211958 -0.284698 0.128394 0.128394 0.128394 0.599684 -0.566424 IMPROPER -M CA N H CA +M C O DONE ACE BEGINNING GROUP ACE INT 1 CORR NOMI DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.000 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.000 90.000 0.000 0.00000 4 HH31 HC M 3 2 1 1.000 90.000 180.000 0.076010 5 CH3 CT M 4 3 2 1.090 90.000 180.000 -0.190264 6 HH32 HC E 5 4 3 1.090 109.500 60.000 0.076011 7 HH33 HC E 5 4 3 1.090 109.500 300.000 0.076010 8 C C M 5 4 3 1.530 111.100 180.000 0.512403 9 O O E 8 5 4 1.229 120.500 0.000 -0.550170 CHARGE 0.076010 -0.190264 0.076011 0.076010 0.512403 -0.550170 IMPROPER CH3 +M C O DONE N-methyl all atom NME INT 1 CORR OMIT DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000 4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.423888 5 H H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.290111 6 CH3 CT M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 -0.054293 7 HH31 H1 E 6 4 3 1.090 109.500 0.000 0.062690 8 HH32 H1 E 6 4 3 1.090 109.500 120.000 0.062690 9 HH33 H1 E 6 4 3 1.090 109.500 240.000 0.062690 CHARGE -0.423888 0.290111 -0.054293 0.062690 0.062690 0.062690 IMPROPER -M CH3 N H DONE NH2 ENDING GROUP NHE INT 1 CORRECT OMIT DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.0000 0.0000 0.0000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.0000 0.0000 0.0000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.0000 90.0000 0.0000 4 N N M 3 2 1 1.3350 116.6000 180.0000 5 HN1 H E 4 3 2 1.0100 119.8000 0.0000 6 HN2 H E 4 3 2 1.0100 119.8000 180.0000 CHARGE -0.46300 0.23150 0.23150 IMPROPER -M HN1 N HN2 DONE WATER, TIP3P MODEL HOH HOH INT 1 CORR OMIT DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.000 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.000 90.000 0.000 0.00000 4 H1 HW M 3 2 1 1.000 101.430 -98.890 0.41700 5 O OW M 4 3 2 0.9572 104.520 -39.220 -0.83400 6 H2 HW E 5 4 3 0.9572 104.520 -151.000 0.41700 LOOP H1 H2 DONE ASP neutral ASH ASH INT 1 CORR OMIT DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000 4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.392069 5 H H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.282413 6 CA CT M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 -0.035317 7 HA H1 E 6 4 3 1.090 109.500 300.000 0.094292 8 CB CT 3 6 4 3 1.525 111.100 60.000 -0.121405 9 HB2 HC E 8 6 4 1.090 109.500 300.000 0.069032 10 HB3 HC E 8 6 4 1.090 109.500 60.000 0.069032 11 CG C B 8 6 4 1.527 109.470 180.000 0.678640 12 OD1 O E 11 8 6 1.260 117.200 90.000 -0.550940 13 OD2 OH S 11 8 6 1.260 117.200 270.000 -0.587163 14 HD2 HO E 13 11 8 0.96 109.5 180.000 0.438035 15 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.620495 16 O O E 15 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.565045 CHARGE -0.392069 0.282413 -0.035317 0.094292 -0.121405 0.069032 0.069032 0.678640 -0.550940 -0.587163 0.438035 0.620495 -0.565045 IMPROPER -M CA N H CA +M C O CB OD1 CG OD2 DONE GLU neutral GLH GLH INT 1 CORR OMIT DU BEG 0.00000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000 4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.384536 5 H H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.263963 6 CA CT M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 -0.060898 7 HA H1 E 6 4 3 1.090 109.500 300.000 0.109620 8 CB CT 3 6 4 3 1.525 111.100 60.000 -0.018753 9 HB2 HC E 8 6 4 1.090 109.500 300.000 0.034966 10 HB3 HC E 8 6 4 1.090 109.500 60.000 0.034966 11 CG CT 3 8 6 4 1.510 109.470 180.000 -0.038364 12 HG2 HC E 11 8 6 1.090 109.500 300.000 0.048444 13 HG3 HC E 11 8 6 1.090 109.500 60.000 0.048444 14 CD C B 11 8 6 1.527 109.470 180.000 0.638937 15 OE1 O E 14 11 8 1.260 117.200 90.000 -0.559031 16 OE2 OH S 14 11 8 1.260 117.200 270.000 -0.588722 17 HE2 HO E 16 14 11 0.960 109.500 180.000 0.447661 18 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.587056 19 O O E 18 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.563753 CHARGE -0.384536 0.263963 -0.060898 0.109620 -0.018753 0.034966 0.034966 -0.038364 0.048444 0.048444 0.638937 -0.559031 -0.588722 0.447661 0.587056 -0.563753 IMPROPER -M CA N H CA +M C O CG OE1 CD OE2 DONE Sodium Ion CIP CIP INT 1 CORR OMIT DU BEG 0.000000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.0000 0.0000 0.0000 0.000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.0000 90.0000 0.0000 0.000 4 NA+ IP M 3 2 1 1.0000 90.0000 180.0000 1.000 DONE Chloride Ion CIM CIM INT 1 CORR OMIT DU BEG 0.000000 1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 2 DUMM DU M 1 0 -1 1.0000 0.0000 0.0000 0.000 3 DUMM DU M 2 1 0 1.0000 90.0000 0.0000 0.000 4 CL- IM M 3 2 1 1.0000 90.0000 180.0000 -1.000 DONE STOP